מרפאה גסטרואנטרולוגית היא מתקן רפואי המתמחה באבחון וטיפול במצבים ומחלות הפוגעים במערכת העיכול, הכוללים את הוושט, הקיבה, המעי הדק, המעי הגס (מעי הגס), הכבד, כיס המרה והלבלב. גסטרואנטרולוגים הם רופאים המתמחים בטיפול במצבים אלו ולרוב עובדים במרפאות גסטרואנטרולוגיה. מטופלים עשויים לבקר במרפאה גסטרואולוגיה מסיבות מגוונות, כגון חווים תסמינים כגון כאבי בטן, נפיחות, שלשול, עצירות, צרבת או קשיי בליעה, או לקבל בדיקות מניעתיות כגון קולונוסקופיה. במהלך ביקור במרפאה גסטרואנטרולוגית, מטופל עשוי לעבור מגוון בדיקות והליכים אבחוניים, כגון אנדוסקופיות, קולונוסקופיות או ביופסיות, ולקבל טיפול במצבים כגון מחלת מעי דלקתית (IBD), תסמונת המעי הרגיז (IBS), או מחלת כבד.